山东省农科院等单位联合破译德州驴基因组
时间：2020-12-21 来源：中国农科新闻网 作者：未知
日前，由山东省农业科学院与东阿阿胶股份有限公司主导，联合国内外多家单位共同合作的“德州驴基因组开发及其产业化应用”项目传来捷报，该项目团队已获得国际首个组装到染色体水平的家驴基因组参考图谱，研究成果于12月9日在Nature子刊《Nature Communications》在线发表，为马属动物遗传资源保护和利用及家驴基因组育种和遗传改良提供了重要理论支撑。
驴产业是我国畜牧业中的特色产业，在世界上具有领先优势。作为名贵中药材“阿胶”的重要原料供体，驴其不仅是畜牧业中的重要一员，也是医疗康养界的“明星”。作为阿胶产业核心省份的山东，为深入挖掘优良品种“德州驴”的遗传资源，进一步提升遗传资源利用水平，山东省农科院联合东阿阿胶股份有限公司，于2014年底联合发起了“德州驴基因组开发及其产业化应用”项目，经过5年多的不懈攻关，最终成功构建了德州驴染色体水平的高质量参考基因组图谱。该参考基因组用到了二代测序（Hiseq sequencing）、三代测序(PacBio sequencing)和染色体构象捕获技术(Hi-C)，其Scaffold N50达到93.37 Mb，是目前奇蹄目马属动物中连续性最好的参考基因组。
我国大型优良驴品种多为深毛色，小型驴品种及野驴多为浅毛色，其背后的分子机制对于培育优良驴品种具有重要意义。德州驴作为深毛色优良率品种，其基因组不仅为马属动物的起源进化研究提供数据基础，也为优良遗传资源保护和利用、家驴基因组选择育种和遗传改良、家驴分子设计育种提供数据支撑。作者：张伟 吕兵兵
